В девети век западната Туркестан стана достояние на мюсюлманската Персийския Samanids, който е направил Бухара (техния капитал) за съперник на Багдад в красотата и културата. Контрол на региона спадна на турците през 999, а местното население се абсорбират постепенно от тях.
монголите на Чингис хан завладели цяла Централна Азия през 1219-20 и Туркестан стана част от Монголската империя , Заповедта поддържа от монголите направи възможно за Марко Поло да пътуват над стария път на коприната до Китай през 1270-те години, и в резултат на търговия процъфтява в продължение на няколко века.
<Р> Тъй като Монголската империя започва да се разбият в 14-ти век, Тамерлан завзе властта на запад. При наследниците му, обаче, империята му се сви до района на Бухара-Самарканд и в началото на 16 век тя изчезна. Туркестан е разделена между няколко враждуващи турски княжества. Пътя на коприната става твърде опасно да се използва; Антъни Дженкинсън, един английски търговец, в 1558 може да отиде по-далеч на изток от Бухара. Морски маршрути до Далечния Изток са били открити обаче, и Централна Азия вече не е важно за западния свят.
В средата на 18 век Русия разширява дейността си в северозападна Туркестан и Китай започна подчиняване на югоизточния регион. Окончателните териториални аванси на Русия настъпили през втората половина на 19 век. През 1922 г. западните и централните части на Туркестан станаха част от Съветския съюз. Съветски Туркестан е съставена от узбекските, Туркменски, таджик, киргизкото, и част от казахстанските съветските социалистически републики. През 1991 г., след разпадането на Съветския съюз, тези републики станаха независими. 
[1] [2]