И все пак магнитен резонанс също има своите недостатъци. На първо място, това е скъпо. Второ, тя може да улови само ясно изображение, ако лицето се сканира остава напълно неподвижно. И трето, изследователите все още не напълно разбират как работи.
<Р> Най-голямото оплакване от страна на изследователите е, че магнитен резонанс може да гледа само на притока на кръв в мозъка. Тя не може да дома си в за дейността на отделните нервни клетки (неврони), които са от решаващо значение за психическото функция. Всяка област на мозъка проучен в магнитен резонанс е съставена от хиляди отделни неврони, всеки от които може да имат уникална история за разказване. Защото някои области на мозъка, които " " светват; върху магнитен резонанс може да представлява няколко различни функции, това е трудно да се каже точно какъв вид на мозъчната дейност е представена на сканирането.
В допълнение, резултатите от сканиране магнитен резонанс може да бъде трудно да се тълкува. Например, в едно проучване UCLA от изследователя Marco Iacoboni, когато суинг избиратели бяха показани думите " демократ, " " " Републиканската; и " независима, " област на мозъка, наречена амигдала се активира, което показва, чувство на безпокойство и отвращение. Но трите условия също предизвикват дейност в области от мозъка, свързани с наградата, желание и свързаност. И така, как тези политически план правят субектите чувстват - отвратен или свързан? Беше трудно за учените да кажа със сигурност. [Източник: Scientific American]
<р> Поради тези недостатъци, някои критици твърдят, че магнитен резонанс е нищо повече от една високотехнологична версия на френология, псевдо на 19-ти век -science, че претендира да разкрива характера на човека въз основа единствено на формата на неговия или нейния череп. В бъдеще учените се надяват да направят магнитен резонанс повече " " научна; и подобряване на нейната точност, като се фокусира върху индивидуалните неврони. Те мислят, че като записва електрическата активност в невроните, те ще получат по-пълна и точна картина на мозъчната дейност.